轉錄因子結合位點方法

轉錄因子結合位點方法

高通量檢測轉錄因子或DNA結合蛋白

在基因組上的結合位點

在功能基因組學和表觀遺傳學研究中，轉錄因子結合位點(TFBS)的發掘一直是研究熱點。傳統的ChlP-seq(染色質免疫共沉淀測序)方法，在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。

然而,好的抗體可遇不可求，

這限制了ChlP-seq更廣泛的應用。

DAP-seq技術的出現,

使TFBS的研究不再局限于物種，

不再受抗體質量的限制,

為生命科學和醫學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。

生信分析

1

對原始數據進行去除接頭、污染序列及低

Peak序列模式發掘(motif search)

質量reads的處理

已知motif注釋

數據產出統計

Peak相關基因鑒定

3參考序列比對分析

1Peak相關基因的GO和KEGG富集分析

測序reads富集區域掃描(peak calling)

Peak長度分布統計

1

測序數據的差異分析(>=2個樣本)

Peak在基因功能元件上的分布統計

1測序數據的可視化分析

項目可行性分析

本地保存成功

x

開展項目之前,我們會根據您具體的轉錄因子做可行性分析報告,供您參考,從多個方面進行可行性分析,包括轉錄因子分子量,亞細胞定位預測,跨膜區預測,蛋白質結構域預測、翻譯后修飾預測,并且根據文獻報道和我們的經驗來進行可行性分析。

轉錄因子結合位點方法

相關服務：

1、 凝膠阻滯實驗（EMSA）：DAP-seq后續驗證服務。

2、 酵母單雜交：DAP-seq后續驗證服務

3、 ChIP-seq：高效檢測重組蛋白、轉錄因子在基因組的結合位點

4、 DAP-seq與RNA-seq聯合分析： 分析轉錄因子的靶基因在RNA-seq數據中的表達變化，深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數據，增加轉錄組測序的分析深度。

5、 DNA-pull down：鑒定與DNA結合的蛋白。

6、 精美的論文圖片設計與制作：專業設計師，設計精美論文插圖，提升論文的嚴謹性和美觀度。

DAP-seq是基于DNA親和純化，通過體外表達轉錄因子鑒定TFBS的技術，具有不受抗體和物種限制，且高通量的優勢，自該技術問世以來，已被廣泛應用于轉錄調控和表觀組學的研究。能幫助您快速找到轉錄因子的結合位點，尋找轉錄因子調控的靶基因。